한국 재래 돼지에 특이적인 ＤＮＡ 단편 및 그 단편을이용한 한국 재래 돼지 감별방법 document_id A220517010007

본 발명은 한국 재래 돼지에 특이적인 DNA 단편 및 그 단편을 이용한 한국 재래 돼지 감별방법에 관한 것이다. 돼지 백혈구 항원(SLA;swine leukocyte antigen)은 포유류를 포함하는 여러 척추동물 종의 면역반응을 조절하는 주된 요소 군인 돼지의 MHC 분자이다. MHC 분자는 질병 조절 또는 세포 또는 조직 이식에서 주요한 역할을 하므로 MHC 유전자들의 뉴클레오타이드 변이 및 다른 분자들과의 분자적 상호작용을 이해하기 위한 많은 노력들이 있었다(Fleckenstein et al.,(1999) Quantitative analysis of peptide-MHC class II interaction. Semin Immunol. 11: 405-16 ). 현재까지 인간에서 1500 여개 이상의 다른 대립유전자들(alleles)의 MHC 유전자들이 결정되었다(Robinson et al., Marsh SG(2003) IMGT/HLA and IMGT/MHC: sequence databases for the study of the major histocompatibility complex. Nucleic Acids Res. 31: 311-314). 그러나 다른 종들에서의 대립유전자 변이에 대한 연구는 빈약하였다. 전통적인 클래스-I SLA 유전자들은 SLA-1, SLA-2 및 SLA-3로 구성된다(Chardon et al., 2000; The porcine major histocompatibility complex and related paralogous regions: a review. Genet Sel Evol. 32: 109-128). 최근, SLA 클래스-I 시스템의 명명법이 GenBank에 공개된 서열의 분석에 기초하여 제안되었다(Smith et al., 2005;Nomenclature for factors of the SLA class-I system, 2004. Tissue Antigens. 65: 136-49). 그 결과는 GenBank의 모든 SLA-1, SLA-2 및 SLA-3 서열은 각각 16, 15 및 7 그룹으로 분류된다는 것을 나타낸다. 돼지에서 MHC 유전자들의 다형성에 대한 체계적인 연구들을 수행하기 위해서 SLA 유전자들에 대한 더 많은 서열 정보가 필요하다. 최근 수입 농축수산물에 대한 많은 문제가 제기되고 있고, 이러한 수입 농축수산물과 국산 농축수산에 대한 구별 방법에 대한 절실한 필요가 존재한다. 그러나 한국 재래 돼지에 대한 SLA 유전자들의 서열타입들에 대한 보고가 없었다. 따라서 본 발명자들은 다수의 개체에서 온 한국 재래 돼지들의 SLA-2 유전자들을 클론하고 서열분석하고 그 결과를 분석하였다. 그 결과는 한국 재래 돼지 SLA-2 유전자에서 온 두 대립유전자들이 공지된 SLA-2 유전자들과 비교하여 매우 독특하다는 것을 확인하였다. 또 다른 한 대립유전자는 존재하는 대립유전자에 대한 뉴클레오타이드 변이와 유사하다.